Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CNBD1Q8NA66 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CNBD1Q8NA66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms