Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC89Q8N998 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC89Q8N998 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms