Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOT2Q8IXI1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOT2Q8IXI1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms