Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NPAS3Q8IXF0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPAS3Q8IXF0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms