Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLF2Q8IX21 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLF2Q8IX21 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms