Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CERS3Q8IU89 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CERS3Q8IU89 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms