Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NME9Q86XW9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NME9Q86XW9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms