Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HAPLN4Q86UW8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HAPLN4Q86UW8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms