Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LHFPL3Q86UP9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LHFPL3Q86UP9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms