Protein–RNA interactions for Protein: Q86UF4

CCDC190, Coiled-coil domain-containing protein 190, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC190Q86UF4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC190Q86UF4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms