Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATG9AQ7Z3C6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms