Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUP54Q7Z3B4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP54Q7Z3B4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms