Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDXQ7Z353 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDXQ7Z353 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms