Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SV2BQ7L1I2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SV2BQ7L1I2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms