Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMIM5Q71RC9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM5Q71RC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms