Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TOM1L2Q6ZVM7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TOM1L2Q6ZVM7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TOM1L2Q6ZVM7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms