Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CASC2Q6XLA1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CASC2Q6XLA1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms