Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L3Q6VB84 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXD4L3Q6VB84 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms