Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APOA5Q6Q788 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOA5Q6Q788 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms