Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC137Q6PK04 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms