Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDF2Q6PJF5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHBDF2Q6PJF5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms