Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC42EP5Q6NZY7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP5Q6NZY7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms