Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD54Q6NXT1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54Q6NXT1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms