Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MRNIPQ6NTE8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MRNIPQ6NTE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms