Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGP8Q6NSW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGP8Q6NSW7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms