Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPECC1LQ69YQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPECC1LQ69YQ0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms