Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDCA2Q69YH5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDCA2Q69YH5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.8 ms