Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
INTS3Q68E01 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INTS3Q68E01 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms