Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E4F1Q66K89 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
E4F1Q66K89 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms