Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC38Q5VT99 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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LRRC38Q5VT99 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LRRC38Q5VT99 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC38Q5VT99 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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