Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRAMEF5Q5TYX0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PRAMEF5Q5TYX0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms