Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HES3Q5TGS1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HES3Q5TGS1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HES3Q5TGS1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms