Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC18Q5T9S5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CCDC18Q5T9S5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CCDC18Q5T9S5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms