Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1TD1Q5T7N2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1TD1Q5T7N2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1TD1Q5T7N2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms