Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
C10orf55Q5SWW7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C10orf55Q5SWW7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms