Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRN2

C6orf10, Uncharacterized protein C6orf10, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf10Q5SRN2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C6orf10Q5SRN2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf10Q5SRN2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf10Q5SRN2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C6orf10Q5SRN2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C6orf10Q5SRN2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms