Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TTC39AQ5SRH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TTC39AQ5SRH9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms