Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PHYHD1Q5SRE7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms