Protein–RNA interactions for Protein: Q5PR19

Putative UPF0607 protein LOC392364, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5PR19 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q5PR19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q5PR19 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5PR19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5PR19 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5PR19 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q5PR19 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q5PR19 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q5PR19 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q5PR19 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q5PR19 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms