Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB41Q5JT25 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB41Q5JT25 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms