Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN4Q5BKX8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN4Q5BKX8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CAVIN4Q5BKX8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CAVIN4Q5BKX8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN4Q5BKX8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN4Q5BKX8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN4Q5BKX8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CAVIN4Q5BKX8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms