Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPL39P5Q59GN2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms