Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC44A4Q53GD3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC44A4Q53GD3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms