Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C4orf46Q504U0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms