Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDO1Q16878 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDO1Q16878 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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