Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP2B3Q16720 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP2B3Q16720 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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