Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDK4Q16654 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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PDK4Q16654 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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PDK4Q16654 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDK4Q16654 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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