Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STX1AQ16623 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STX1AQ16623 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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