Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCAQ16586 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SGCAQ16586 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SGCAQ16586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SGCAQ16586 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SGCAQ16586 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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