Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ZFHX3Q15911 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ZFHX3Q15911 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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